Nvidia dá assinatura gratuita do Parabricks a pesquisadores do Covid-19
Créditos: Sing Comunicação/ Reprodução

Nvidia dá assinatura gratuita do Parabricks a pesquisadores do Covid-19

Software de sequenciamento de genoma para GPUs acelera o processo para entender mais sobre o novo coronavírus

Em resposta à pandemia do novo coronavírus (COVID-19), a NVIDIA Enterprise compartilha ferramentas com pesquisadores ao redor do globo que podem acelerar a corrida para entender o COVID-19 e ajudar a formular uma resposta ao vírus.

A NVIDIA passa a fornecer uma licença gratuita de 90 dias ao software Parabricks para qualquer pesquisador no esforço mundial de combater o COVID-19. Baseado no conhecido Genome Analysis Toolkit, o Parabricks usa GPUs para acelerar em até 50 vezes a análise de dados de sequência.

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Para pesquisadores que trabalham com dados de leitura longa da Oxford Nanopore, um repositório de ferramentas aceleradas por GPU está disponível no GitHub. Além disso, os seguintes aplicativos já possuem a aceleração da GPU NVIDIA integrada: Medaka, Racon, Raven, Reticulatus, Unicycler.

“O sequenciamento do novo coronavírus e o genoma das pessoas atingidas pelo COVID-19 são necessários para compreender mais sobre a doença e, assim, produzir novos medicamentos e vacinas. Esse tipo de análise normalmente leva tempo e por isso disponibilizamos nossas ferramentas gratuitamente que conseguem acelerar o processo em até 50 vezes”, explica Marcio Aguiar, gerente sênior da divisão NVIDIA Enterprise para América Latina.

19/03/2020 às 05:15
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A NVIDIA Enterprise reconhece que a pandemia está em evolução e seguirão monitorando a situação para estender a oferta conforme necessário.

A aceleração da ciência faz parte da missão principal da NVIDIA Enterprise. A equipe da Parabricks ingressou na NVIDIA em dezembro de 2019, fornecendo a ferramenta mais recente para esse trabalho. Esse software pode reduzir o tempo variante de um sequenciamento de genoma humano inteiro de dias para menos de uma hora em um único servidor. Dada a disseminação sem precedentes da pandemia, obter resultados em horas em vez de dias pode ter um impacto extraordinário no entendimento da evolução do vírus e do desenvolvimento de vacinas.

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A NVIDIA Enterprise aproveita o momento para convidar todos os parceiros a se juntarem para combinar esse esforço urgente de ajudar a comunidade de pesquisa. A empresa também tem conversado com provedores de serviços em nuvem e centros de supercomputação para fornecer recursos de computação e acesso ao Parabricks em suas plataformas.

Aqueles que desejam utilizar o Parabricks, precisam preencher a licença neste formulário e ter acesso às GPUs NVIDIA.

Fonte: Parabricks
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Neri Neto

O universo geek faz parte do dia a dia, da vida, deste jornalista. Formado pela Universidade Federal de Santa Catarina, Neri Neto é responsável por conteúdos diversos no Mundo Conectado. Ele adora tecnologia, cinema, games e descobriu ainda na infância que a linguagem dos vídeos seria perfeita para falar de tudo que ama. Neri também fala bastante em terceira pessoa, gosta de descontrair e está sempre nas redes sociais.

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